محافظة كفر الشيخ قديماُ كانت الإقليم السادس من أقاليم الوجه البحرى وتضم عاصمتها القديمة وهى (خاسوت) الفرعونية (ضاحية سخا الحالية التابعة لمدينة كفر الشيخ) وهناك أيضاُ العديد من المناطق الأثرية الهامة التى تشغل أطلالها حالياُ حوالى 2000 فدان من الأراضى الأثرية بمختلف أرجاء المحافظة عبارة عن تلال أثرية أشهرها تل الفراعنة بدسوق وتل قبريط بفوه وتل الخنزيرى بالرياض وتل سيدى سالم وتل الجلاجل ببلطيم وتلال سنجار ومسطروة والكوم الأخضر ببحيرة البرلس.
ومن الثابت تاريخياُ أن مصر عرفت مملكتين فى بداية تاريخ مصر الموحدة الأولى فى الوجه القبلى وعاصمتها (نخن ) والثانية فى الوجه البحرى وعاصمتها (بوتو ) وقد احتفظ هذان المركزان القديمان للحكم فى مصر بأهميتهما وشهرتهما طوال العصور التاريخية وهذه الاثار.
وكانت مدينة (بوتو ) عاصمة للوجه البحرى قبل عصر التوحيد اختصتها مصادر العصور التاريخية فى مصر القديمة بحضانة الطفل ( حورس ) الذى وضعته أمه (إيزيس ) بتلك الجزيرة المجاورة لها (أخبيت) قرية شابه الحالية مركز دسوق فى أحراش الدلتا ليكون تحت رعاية وحماية الألهة (واجبت) ربة مدينة بوتو وليكون بعيداُ عن بطش عمه (ست) ومن أهم القطع الأثرية المكتشفة بتل الفراعين الحالى وهو موقع مدينة بوتو عاصمة الوجه البحرى فى عصر ما قبل التاريخ، تمثالان على هيئة أبو الهول من البازلت يعودان إلى الأسرة التاسعة والعشرين، تمثال للآله (حورس الصقر)، تمثال مزدوج من الجرانيت الوردى للملك رمسيس الثانى والآله سخمت، لوحة من الجرانيت الأسود تعود لعصر الملك تحتمس الثالث، لوحة من الجرانيت الوردى تعود لعصر الملك شاشانق الأول من الأسرة الفرعونية.
وكانت تل الفراعين عاصمة مصر في عصر ما قبل الأسرات, وكانت تعتبر المصدر الوحيد لإضفاء شرعية الحكم لملوك مصر حيث كان عليهم الذهاب إلي يوتو لتقديم القرابين للإلهة واجت ربة تل الفراعين ومانحة السلطة, وتحتوي علي جبانة (يوتو العظيمة) التي وجد بداخلها آلاف التوابيت البرميلية الشكل والآدمية أيضا وهي أشكال غاية في الندرة منقوش عليها كتابات توضح طقوس دفن الموتي عند قدماء المصريين بالإضافة إلي مجموعة تمائم وحلي, أما منطقة المعابد التي تمتد لمساحة تسعة آلاف متر مربع ولم يكتشف من معابدها سوي معبد الإلهة واجت بينما تؤكد الكتابات الآثرية أن هناك معابد للإلهة إيزيس والإله حور وآلهة آخرين.
وتقع سخا الحالية على بعد حوالى 2 كم من مدينة كفر الشيخ إلى الجنوب منها وهى خاسوت الفرعونية واكسويز اليونانية الرومانية وكانت سخا عاصمة الأقليم السادس من أقاليم الوجه البحرى وقد كانت مقراُ وعاصمة للأسرة الرابعة عشرة الفرعونية، وأهم آثار سخا ، تمثال من البرونز يبلغ ارتفاعه 11 / 1 م ويمثل معبوداُ طفلآ يرجح أنه (أبوللو ) ويعود للعصر اليونانى الرومانى، لوحة من الحجر الجيرى عليها نقوش هيروغليفية تمثل رموزاُ لعدد من أقاليم مصر القديمة، تمثال رابض لأسد فاقد الرأس والرقبة والساقين الأماميين، بقايا حمام رومانى وأساسات منطقة سكنية وأجزاء من السور الخارجى الضخم الذى كان يحيط بمدينة سخا القديمة.
تل الخنزيرى :
يقع تل الخنزيرى البالغ مساحته 53 فداناُ بمركز الرياض بمحافظة كفر الشيخ على بعد حوالى 20 كم من الشمال الشرقى لمدينة كفر الشيخ ويرجح الباحثون فى مجال الآثار والتاريخ أنه موقع مدينة كانت مقراُ لأسرة فى العصر القبطى كانت ذات شأن كبير.
تل الخوالد :
يقع تل الخوالد البالغ مساحته 80 فداناُ بمركز سيدى سالم وعلى بعد حوالى 40 كم إلى الشمال الغربى من مدينة كفر الشيخ ولم تجر أية حفائر علمية بالتل حتى الان ولكن يرجح أنه كان موقعا لمدينة أو قرية فرازنيز وكانت مقراُ لأسقفية وتدل الشواهد الأثرية على السطح انها بقايا يونانية رومانية.
تل الخبيز :
يقع تل الخبيز البالغ مساحته 13 فداناُ بمركز سيدى سالم ويبعد حوالى 75 كم من مدينة كفر الشيخ ويرجح أن يكون هذا التل موقع مدينة أخبيت أو جزيرة أخبيت المصرية القديمة القريبة من مدينة بوتو القديمة هذا بخلاف كثير من التلال الأثرية الأخرى المنتشرة فى كافة أرجاء المحافظة لم يتم التنقيب فيها بعد.